Боксы микробиологической безопасности используются для физической изоляции (удержания и контролируемого удаления из рабочей зоны) микроорганизмов с целью предотвращения возможности заражения персонала и контаминации воздуха рабочей зоны и окружающей среды. Согласно европейскому стандарту EN 12469:2000 различают три класса боксов биологической безопасности. ГОСТ Р ЕН 12469-2010 рекомендует называть оборудованиие данного вида бокс микробиологической безопасности.
Боксами микробиологической безопасности оснащаются индивидуальные рабочие места в медицинских, бактериологических и вирусологических лабораториях, где осуществляется работа с патогенными биологическими агентами (ПБА) I – IV групп.